La Alcaldia de San Jose del Guaviare, es una entidad de control que vigila el manejo actividades públicas para el Municipio del Departamento. Cuida que los recursos de los hospitales, las empresas de servicio y de todas aquellas que funcionan con dinero público sean bien manejados.

De igual manera, la Alcaldia de San Jose del Guaviare, contribuye a la protección de nuestros recursos naturales, principalmente el vital recurso del agua.

La alcaldía de San José del Guaviare tiene como misión establecer e implementar planes, programas y proyectos que propicien el desarrollo social, económico, ambiental, cultural y político en el territorio, de forma participativa, equitativa e incluyente; garantizando los derechos fundamentales, promoviendo el trabajo colectivo, el desarrollo humano, el respeto a la vida, la dignidad humana y el crecimiento económico sostenible de sus habitantes.